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糖合成酶是一種分子內轉糖基酶,催化麥芽寡糖(淀粉液化液)還原端的葡萄糖基和相鄰的葡萄糖基間的A,A-1,4-葡萄糖苷鍵轉化成A,A-1,1-葡萄糖苷鍵,生成麥芽寡糖基海藻糖;麥芽寡糖基海藻糖水解酶專一水解麥芽寡糖基海藻糖的麥芽寡糖基和海藻糖基間的A,A-1,4-糖苷鍵,以上兩種酶聯合作用,每次從麥芽寡糖生成海藻糖和少兩個葡萄糖單位的麥芽寡糖。4.基因重組法基因重組法包括兩個方面:一是利用工程微生物和酶工程改進海藻糖生產,提高產量,降低成本;二是利用與合成海藻糖相關的基因構建具有抗逆性的轉基因植物。

海藻糖有3種光學異構體，分別是α，α-海藻糖（蘑菇糖，Mushroom Sugar）、α，β-海藻糖（新海藻糖，Neotrehalose）和β，β-海藻糖（異海藻糖，Isotrehalose）。其中只有α，α-海藻糖在自然界中以游離狀態存在，即為通常所說的海藻糖，廣泛存在于各種生物體中，包括細菌、酵母、真菌和藻類以及一些昆蟲、無脊椎動物和植物中，尤其在酵母中含量較多，面包和啤酒等發酵食品及蝦類等也含有海藻糖。α，β-型和β，β-型在自然界中很少見，僅在蜂蜜和蜂王漿中發現了少量的α，β-型海藻糖，α，β-型和β，β-型這兩種海藻糖可以化學合成。