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通常情況下，花色苷的基本C骨架會被一個或者多個糖昔以及酞基化糖昔聯接，因而具有將強的極性。傳統花色苷的提取方法主要根據其極性采取適當的溶劑進行提取，目前研究報道較多的花色苷提取溶劑主要分為水、親水性有機溶劑以及親脂性有機溶劑。其中親水性有機溶劑主要包括甲醇、乙醇、乙睛以及丙酮等，主要用來提取水溶性花色苷；親脂性有機劑主要包括二氯甲烷、乙酸乙酷、石油醚、氯仿、苯、乙醚等，主要用來提取脂溶性花色苷。為防止花色苷的降解，提高花色苷提取率，常在提取溶劑中加入適量無機酸或有機酸以降低溶劑pH值。常用無機酸主要有鹽酸、硫酸、亞硫酸和碳酸等;常用有機酸主要有甲酸、醋酸、檸檬酸和酒石酸等。隨著科學技術的迅猛發展，像超臨界流體萃取、微波輔助提取、超聲波提取、微生物破壁、酶解等新興提取方法正改變著傳統提取方式，使花色苷提取工藝向著生產環保、節約能源、提取率高、操作簡便等方向發展。